江苏省药物研究所原名南京药物研究所，成立于1962年7月,原隶属于江苏省卫生厅，2006年12月，整体划转南京工业大学，是专门从事新药创新与开发研究的国有科研机构,江苏省新药临床前研究基地。
    江苏省药物研究所学科建设和科研设备齐全，拥有江苏省药物安全评价中心(国家GLP认证)、江苏省药物新制剂研究及工程化技术服务中心、江苏省实验动物质量检测站（国家计量认证）等平台，设有药物化学研究室、天然药物研究室、药理毒理研究室、药物制剂及质量研究室、药品包装材料相容性研究中心、医疗器械相容性研究及检测中心，已经形成了完整的新药临床前研究技术体系。建有图书信息、数字图书、所内计算机网络、宽带接入、实验动物等科研辅助设施。拥有UPLC- MS/MS、LC-MS/MS、傅里叶红外光谱Thermo fisher NICOLETIS10、高效液相色谱（自动进样，各型检测器）30台、微粒分析仪Malvern Zetasizer Nano、高压均质机EF-C5、西门子动物血液全自动分析仪、实验动物生理遥测系统等一大批先进仪器设备，拥有化学药物合成中试线（25升、50升、100升多功能玻璃反应器）、药物制剂中试线（片剂、胶囊、颗粒剂、冻干剂、注射液、贴剂、软胶囊等），固体制剂规模5Kg，液体制剂100L。 
    目前研究所共有职工94人，目前全所科研人员73名，高级职称6人，副高15人；博士6人，硕士25人。省“333”人才工程2名,省六大人才高峰4名。 
    近十年来,研究所承担国家863课题2项、国家自然科学基金课题12项、国家攻关项目5项、国家新药创制重大专项8项,世界银行贷款2项,部、省级重点课题53项,国际合作项目10项、厅局级42项,国内横向协作课题700余项。50余项研究成果获奖(其中国际奖1项,国家级奖5项,部省级奖26项),获得发明专利34项。在国内外各类学术刊物上发表论文900余篇，编写和参加编写专著、译著20余部。在国际交往中,研究所与美、英、法、日、德、瑞典、比利时、澳大利亚、东南亚等国进行了学术交流,接待近50批百余名专家来所访问,并与世界卫生组织(WHO)、国际化学科学发展组织(IOCD)、美国德州农工大学眼科药理研究所以及美国博士伦公司、香港福高制药有限公司等建立了科研合作关系,25人参加国际性学术交流,3名专家担任国际性专业机构会员或理事。 
    江苏省药物研究所新药研制开发能力较强，在新药产品研究开发取得较好的成绩，共获国家新药证书172份。新药成果转化率达98%以上。累计为相关合作企业创造产值超过250亿元。代表性新药成果有：1）注射用紫杉醇脂质体成为率先在国内外上市的脂质体剂型，成果转让绿叶思科药业（康海药业），创造产值12亿元/年，获得中国药学会一等奖（2012）、江苏省科技进步二等奖（2010）。2）注射用两性霉素B脂质体为国内首次上市的新药品种，成果成功转让上海新先锋药业有限公司，创造产值12亿元/年。